باکتری های نیتریفیک کننده به عنوان شیمی اتوتروف طبقه بندی می شوند و به طور گسترده در طبیعت توزیع می شوند. آنها در همه جا یافت می شوند: در خاک، بسترهای مختلف و همچنین بدنه های آبی. روند فعالیت حیاتی آنها کمک زیادی به چرخه کلی نیتروژن در طبیعت می کند و در واقع می تواند به ابعاد عظیمی برسد